MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp21

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000955	AAC	2	6	272	277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365823330
2	NC_000955	AAAT	2	8	335	342	75 %	25 %	0 %	0 %	365823330
3	NC_000955	ATT	2	6	356	361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823330
4	NC_000955	A	6	6	365	370	100 %	0 %	0 %	0 %	365823330
5	NC_000955	CAAAAA	2	12	399	410	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	365823330
6	NC_000955	CCT	2	6	415	420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	365823330
7	NC_000955	AT	3	6	425	430	50 %	50 %	0 %	0 %	365823330
8	NC_000955	CAA	2	6	431	436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365823330
9	NC_000955	A	6	6	439	444	100 %	0 %	0 %	0 %	365823330
10	NC_000955	TAT	2	6	517	522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823330
11	NC_000955	A	6	6	542	547	100 %	0 %	0 %	0 %	365823330
12	NC_000955	ATT	2	6	567	572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823330
13	NC_000955	ACT	3	9	607	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365823330
14	NC_000955	ATGG	2	8	746	753	25 %	25 %	50 %	0 %	11497368
15	NC_000955	AAATT	2	10	792	801	60 %	40 %	0 %	0 %	11497368
16	NC_000955	TAA	2	6	802	807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497368
17	NC_000955	A	7	7	984	990	100 %	0 %	0 %	0 %	11497368
18	NC_000955	AGA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497368
19	NC_000955	TTG	2	6	1075	1080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497368
20	NC_000955	ACA	2	6	1534	1539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
21	NC_000955	AAC	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
22	NC_000955	TAA	2	6	1563	1568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
23	NC_000955	CAA	2	6	1598	1603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
24	NC_000955	AAACA	2	10	1614	1623	80 %	0 %	0 %	20 %	11497361
25	NC_000955	A	6	6	1640	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	11497361
26	NC_000955	A	6	6	1677	1682	100 %	0 %	0 %	0 %	11497361
27	NC_000955	CAA	2	6	1754	1759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
28	NC_000955	ACT	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497361
29	NC_000955	TTA	2	6	1800	1805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
30	NC_000955	A	6	6	1822	1827	100 %	0 %	0 %	0 %	11497361
31	NC_000955	ATAAA	2	10	1838	1847	80 %	20 %	0 %	0 %	11497361
32	NC_000955	A	8	8	1862	1869	100 %	0 %	0 %	0 %	11497361
33	NC_000955	ACTA	2	8	1894	1901	50 %	25 %	0 %	25 %	11497361
34	NC_000955	CAA	2	6	1905	1910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
35	NC_000955	GTAATA	2	12	1952	1963	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11497361
36	NC_000955	ATA	2	6	1967	1972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
37	NC_000955	AGA	2	6	1977	1982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497361
38	NC_000955	AAGA	3	12	1979	1990	75 %	0 %	25 %	0 %	11497361
39	NC_000955	TAA	2	6	2015	2020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
40	NC_000955	ATT	2	6	2021	2026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
41	NC_000955	TTAAAT	2	12	2071	2082	50 %	50 %	0 %	0 %	11497361
42	NC_000955	AAT	2	6	2106	2111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
43	NC_000955	A	6	6	2142	2147	100 %	0 %	0 %	0 %	11497361
44	NC_000955	A	6	6	2234	2239	100 %	0 %	0 %	0 %	11497361
45	NC_000955	A	6	6	2276	2281	100 %	0 %	0 %	0 %	11497361
46	NC_000955	TAT	2	6	2313	2318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
47	NC_000955	GAAA	2	8	2377	2384	75 %	0 %	25 %	0 %	11497361
48	NC_000955	A	7	7	2382	2388	100 %	0 %	0 %	0 %	11497361
49	NC_000955	AAC	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
50	NC_000955	A	7	7	2454	2460	100 %	0 %	0 %	0 %	11497361
51	NC_000955	TAT	2	6	2487	2492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
52	NC_000955	A	9	9	2513	2521	100 %	0 %	0 %	0 %	11497361
53	NC_000955	A	6	6	2530	2535	100 %	0 %	0 %	0 %	11497361
54	NC_000955	AT	3	6	2545	2550	50 %	50 %	0 %	0 %	11497361
55	NC_000955	ATT	2	6	2559	2564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
56	NC_000955	ATA	2	6	2569	2574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
57	NC_000955	ATT	2	6	2585	2590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
58	NC_000955	GAA	2	6	2598	2603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497361
59	NC_000955	A	7	7	2610	2616	100 %	0 %	0 %	0 %	11497361
60	NC_000955	AGAT	2	8	2862	2869	50 %	25 %	25 %	0 %	11497362
61	NC_000955	A	6	6	2874	2879	100 %	0 %	0 %	0 %	11497362
62	NC_000955	T	6	6	2941	2946	0 %	100 %	0 %	0 %	11497362
63	NC_000955	CCT	2	6	2951	2956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497362
64	NC_000955	A	7	7	2970	2976	100 %	0 %	0 %	0 %	11497362
65	NC_000955	AT	3	6	3048	3053	50 %	50 %	0 %	0 %	11497362
66	NC_000955	TAA	2	6	3089	3094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497362
67	NC_000955	TAT	2	6	3125	3130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497362
68	NC_000955	CTC	3	9	3253	3261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497362
69	NC_000955	T	6	6	3269	3274	0 %	100 %	0 %	0 %	11497362
70	NC_000955	GGT	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497362
71	NC_000955	ATT	2	6	3384	3389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497362
72	NC_000955	A	10	10	3390	3399	100 %	0 %	0 %	0 %	11497362
73	NC_000955	AC	3	6	3445	3450	50 %	0 %	0 %	50 %	11497362
74	NC_000955	GAA	2	6	3564	3569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497362
75	NC_000955	TAT	2	6	3573	3578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497362
76	NC_000955	A	8	8	3587	3594	100 %	0 %	0 %	0 %	11497362
77	NC_000955	AAAT	2	8	3629	3636	75 %	25 %	0 %	0 %	11497362
78	NC_000955	TA	4	8	14641	14648	50 %	50 %	0 %	0 %	365823331
79	NC_000955	A	8	8	14654	14661	100 %	0 %	0 %	0 %	365823331
80	NC_000955	A	9	9	14663	14671	100 %	0 %	0 %	0 %	365823331
81	NC_000955	ATA	2	6	14697	14702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823331
82	NC_000955	T	7	7	14927	14933	0 %	100 %	0 %	0 %	365823331
83	NC_000955	GTA	2	6	14964	14969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365823331
84	NC_000955	A	7	7	15010	15016	100 %	0 %	0 %	0 %	365823331
85	NC_000955	A	9	9	15026	15034	100 %	0 %	0 %	0 %	365823331
86	NC_000955	TAA	5	15	15046	15060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823331
87	NC_000955	ATA	2	6	15072	15077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823331
88	NC_000955	GAAA	2	8	15224	15231	75 %	0 %	25 %	0 %	365823331
89	NC_000955	TTAAA	2	10	15232	15241	60 %	40 %	0 %	0 %	365823331
90	NC_000955	A	6	6	15393	15398	100 %	0 %	0 %	0 %	11497364
91	NC_000955	A	6	6	15485	15490	100 %	0 %	0 %	0 %	11497364
92	NC_000955	A	6	6	15527	15532	100 %	0 %	0 %	0 %	11497364
93	NC_000955	TAT	2	6	15564	15569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497364
94	NC_000955	A	7	7	15633	15639	100 %	0 %	0 %	0 %	11497364
95	NC_000955	AAAT	2	8	15671	15678	75 %	25 %	0 %	0 %	11497364
96	NC_000955	AAC	2	6	15698	15703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497364
97	NC_000955	A	7	7	15705	15711	100 %	0 %	0 %	0 %	11497364
98	NC_000955	AAAT	2	8	15713	15720	75 %	25 %	0 %	0 %	11497364
99	NC_000955	AAAAT	2	10	15769	15778	80 %	20 %	0 %	0 %	11497364
100	NC_000955	ACA	2	6	15813	15818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497364
101	NC_000955	A	7	7	15820	15826	100 %	0 %	0 %	0 %	11497370
102	NC_000955	TTA	2	6	15852	15857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497370
103	NC_000955	T	7	7	15880	15886	0 %	100 %	0 %	0 %	11497370
104	NC_000955	A	8	8	15902	15909	100 %	0 %	0 %	0 %	11497370
105	NC_000955	A	6	6	15975	15980	100 %	0 %	0 %	0 %	11497370
106	NC_000955	GTT	2	6	15992	15997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497370
107	NC_000955	TAG	2	6	16005	16010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497370
108	NC_000955	AGTT	2	8	16054	16061	25 %	50 %	25 %	0 %	11497370
109	NC_000955	TAA	2	6	16082	16087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497370
110	NC_000955	TTGT	2	8	16244	16251	0 %	75 %	25 %	0 %	11497365
111	NC_000955	TAA	2	6	16260	16265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497365
112	NC_000955	GTTT	2	8	16412	16419	0 %	75 %	25 %	0 %	11497365
113	NC_000955	T	6	6	16456	16461	0 %	100 %	0 %	0 %	11497365
114	NC_000955	AT	3	6	16486	16491	50 %	50 %	0 %	0 %	11497365
115	NC_000955	A	6	6	16536	16541	100 %	0 %	0 %	0 %	11497365
116	NC_000955	AATT	2	8	16547	16554	50 %	50 %	0 %	0 %	11497365
117	NC_000955	AAC	2	6	16619	16624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497371
118	NC_000955	A	7	7	16626	16632	100 %	0 %	0 %	0 %	11497371
119	NC_000955	TAT	2	6	16659	16664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497371
120	NC_000955	A	9	9	16685	16693	100 %	0 %	0 %	0 %	11497371
121	NC_000955	ACA	2	6	16700	16705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497371
122	NC_000955	AT	3	6	16717	16722	50 %	50 %	0 %	0 %	11497371
123	NC_000955	ATA	2	6	16741	16746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497371
124	NC_000955	A	6	6	16746	16751	100 %	0 %	0 %	0 %	11497371
125	NC_000955	A	6	6	16786	16791	100 %	0 %	0 %	0 %	11497371
126	NC_000955	GTT	2	6	16792	16797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497371
127	NC_000955	AAT	2	6	16900	16905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
128	NC_000955	ATT	2	6	16955	16960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497366
129	NC_000955	ATG	2	6	17004	17009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497366
130	NC_000955	A	10	10	17038	17047	100 %	0 %	0 %	0 %	11497366
131	NC_000955	A	6	6	17177	17182	100 %	0 %	0 %	0 %	11497366
132	NC_000955	TAA	3	9	17206	17214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
133	NC_000955	GTA	2	6	17291	17296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497366
134	NC_000955	TCA	2	6	17297	17302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497366
135	NC_000955	CAA	2	6	17328	17333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497366
136	NC_000955	AGG	2	6	17371	17376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497366
137	NC_000955	ATA	2	6	17378	17383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
138	NC_000955	A	9	9	17389	17397	100 %	0 %	0 %	0 %	11497366
139	NC_000955	TAT	2	6	17428	17433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497366
140	NC_000955	TAA	2	6	17457	17462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
141	NC_000955	A	8	8	17485	17492	100 %	0 %	0 %	0 %	11497366
142	NC_000955	A	8	8	17557	17564	100 %	0 %	0 %	0 %	11497366
143	NC_000955	ATTTT	2	10	17674	17683	20 %	80 %	0 %	0 %	11497366
144	NC_000955	T	7	7	17680	17686	0 %	100 %	0 %	0 %	11497366
145	NC_000955	T	6	6	17689	17694	0 %	100 %	0 %	0 %	11497366
146	NC_000955	A	8	8	17702	17709	100 %	0 %	0 %	0 %	11497366
147	NC_000955	TAT	2	6	17710	17715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497366
148	NC_000955	ATT	2	6	17716	17721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497366
149	NC_000955	GAA	2	6	17774	17779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497366
150	NC_000955	TTG	2	6	17796	17801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497366
151	NC_000955	TAG	2	6	17805	17810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497366
152	NC_000955	GAA	2	6	17816	17821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497366
153	NC_000955	ATA	2	6	17838	17843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
154	NC_000955	AAT	2	6	17864	17869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.